近未来，S组织已经掌握了基因改造技术，他们制造超级士兵，以此来改变世界格局。而其中初代的基因改造战士“巽狼”于实验中发生意外，他回想起已经被删除的片段记忆，曾经的名字“乾武”。于是他从S组织逃离，去寻找自己的过去。